血清メタボロミクス的特徴による乳癌の発見

Jové M, Collado R, Quiles JL, et al. A plasma metabolomic signature discloses human breast cancer. Oncotarget. 2017;

PMID: 28076849

【目的】
「メタボロミクス」とは生物学的試料内の代謝産物に対する包括的な研究の事である．
我々はこのパイロット研究において，血清代謝産物分析によってサブタイプに関わらず乳癌の存在を識別出来るか後ろ向きに検討した．

【方法】
健康な女性20名と乳癌と診断された患者91名の血清試料を用いて，液体クロマトグラフィー質量分析を行った．
乳癌診断のメタボロミクスパネルを生成するために，多変量解析とランダムフォレストによる分類を行った．

【結果】
メタボロミクスによって乳癌患者と健康な人々を正しく区別することが出来た．
乳癌患者と健康な人々を比較したランダムフォレストによるクラス予測解析によって，100%正しく分類することが出来た．
そのため，in-of-bagエラーとout-of-bagエラーに対するクラスエラーはともに0であった．
また，我々は健康な人々と乳癌患者の血清中に異なる濃度を持つ1269個の代謝産物を発見し，計算精密質量，保持時間，同位体分析により，35個の代謝産物を同定した．
これらの代謝産物は，必須生体分子の合成に必要なエネルギーと資材を供給することで，細胞発育を支持している．
ランダムフォレスト，優位性検定，偽発見率（false discovery rate）解析をまとめることで，いくつかの代謝産物が乳癌と強く関わっていることが分かった．

【結論】
乳癌はそのサブタイプに関わらずメタボロミクス的特徴を持ち，またそれは患者血清中に検出することが出来る．